Биологический возраст: как считают эпигенетические часы

Тест «биологического возраста» возвращает число, которое можно сравнить с паспортным. Разница между ними подаётся как итог образа жизни. На деле число — это выход статистической модели, обученной предсказывать нечто конкретное, и от того, что именно она предсказывала, зависит, что разница означает.

Как это устроено

Метилирование ДНК — присоединение метильных групп к отдельным участкам генома. Картина метилирования меняется с возрастом закономерно, и на этом построены «часы»: берут несколько сотен участков, обучают регрессию предсказывать возраст и получают предсказание в годах.

Ключевое: часы не измеряют возраст. Они предсказывают ту величину, на которой обучались. Первые версии обучали на паспортном возрасте, и они хорошо предсказывали именно его — то есть по определению не могли сказать ничего сверх того, что человек и так знает.

Что изменили следующие версии

Дальше модели стали обучать не на возрасте, а на исходах. GrimAge обучали на смертности и на биомаркерах, связанных со смертностью, включая суррогат стажа курения. Разработчики описывают его как биомаркер, предсказывающий продолжительность жизни и время до заболеваний лучше предыдущих версий. Публикация в Aging.

Это существенно меняет смысл: величина, которая коррелирует со смертностью в популяции, — не то же самое, что показатель, отражающий состояние конкретного человека. Обзор предикторов биологического возраста разбирает разные подходы и их ограничения — EBioMedicine.

Почему повторный тест даёт другое число

Отдельная и малоизвестная проблема — техническая надёжность. Работа в Nature Aging, посвящённая именно ей, описывает низкую надёжность повторных измерений у ряда часов и предлагает вычислительное решение, отдельно оговаривая последствия для клинических испытаний и отслеживания в динамике. Публикация в Nature Aging.

Разница в два-три года между двумя тестами может целиком укладываться в погрешность метода. А именно такую разницу продают как результат протокола.

К этому добавляется биологический источник шума. Метилирование измеряют в крови, а состав крови по типам клеток меняется — от инфекции, от воспаления, от времени суток. Часть моделей корректирует состав клеток, часть нет.

Что значит «помолодел на три года»

Эта фраза обычно означает: выход модели во второй раз оказался на три года меньше, чем в первый. Из этого не следует ни того, что изменилось состояние тканей, ни того, что изменился риск заболеть.

Чтобы такое следствие появилось, нужно испытание, где вмешательство меняет и показатель часов, и клинические исходы, причём в одну сторону. Это ровно тот разрыв между суррогатной точкой и исходом, который разбирается в материале про добавки против старения.

Что с этим делают лаборатории

Коммерческий тест обычно не раскрывает, какие именно часы используются, на чём обучалась модель и какова заявленная воспроизводимость. Без этих трёх пунктов результат нельзя ни проверить, ни сравнить с результатом другой лаборатории.

Похожая ситуация с домашними тестами вообще: ответ выглядит точным, потому что выражен числом. Про то же в других категориях — в материалах про ДНК-тесты и питание и про тесты микробиома.

Где это действительно используется

Эпигенетические часы — рабочий инструмент популяционных исследований. Там их применяют к группам, где случайный шум усредняется, а не к одному человеку, где он определяет результат. Различие между «показатель работает на выборке в тысячу человек» и «показатель что-то говорит обо мне» — центральное для всей темы самоизмерений, см. материал про эксперименты на себе.

Посчитать по фото

Частые вопросы

Что измеряют эпигенетические часы?

Картину метилирования ДНК в нескольких сотнях участков генома. Дальше статистическая модель переводит её в число лет. Часы не измеряют возраст, а предсказывают ту величину, на которой обучались.

Чем GrimAge отличается от ранних часов?

Ранние версии обучали предсказывать паспортный возраст. GrimAge обучали на смертности и биомаркерах, связанных со смертностью, поэтому он предсказывает продолжительность жизни и время до заболеваний лучше предыдущих версий.

Почему два теста подряд дают разные числа?

У ряда часов низкая надёжность повторных измерений — этому посвящена отдельная работа в Nature Aging. Добавляется биологический шум: метилирование меряют в крови, а её клеточный состав меняется при инфекции, воспалении и в течение суток.

Что означает «биологический возраст снизился на три года»?

Что выход модели во второй раз оказался на три года меньше. Из этого не следует ни изменение состояния тканей, ни изменение риска заболеть, а сама разница может укладываться в погрешность метода.

Можно ли сравнить результаты двух лабораторий?

Обычно нет. Коммерческие тесты не раскрывают, какие часы используются, на чём обучалась модель и какова заявленная воспроизводимость.

Читайте также

• Добавки «против старения»: NMN, ресвератрол и что показали испытания на людях — У этой полки самая красивая история из всех: молекула, стареющие клетки, продлённая жизнь у мышей.
• ДНК-тест «под ваш геном»: что известно про питание по генам — Обещание звучит убедительно: слюна в пробирке, две недели ожидания — и рацион, подобранный под вашу наследственность.
• Тесты микробиома: почему два образца дают разные ответы — Домашний тест микробиома выглядит как анализ: пробирка, лаборатория, отчёт с процентами и списком продуктов.

Материал носит справочный и информационный характер. Он не является медицинской рекомендацией, диагностикой, назначением лечения или диеты и не заменяет консультацию врача. При заболеваниях, беременности, приёме лекарств и любых состояниях, требующих контроля рациона, решения о питании принимаются с врачом.

Сведения о нормах, регламентах и исследованиях приведены по состоянию на момент подготовки материала и могут измениться; их актуальность следует проверять по первоисточникам. Материал не является рекламой, публичной офертой или индивидуальной консультацией. Автор и владелец сайта не несут ответственности за решения, принятые на основании этого текста.